新农合在县医院和市医院住院报销标准可能不同。分析：新农合（新型农村合作医疗）的报销政策因地区和医院级别而异。一般来说，基层医院（如县医院）的报销比例会高于高级别医院（如市医院），以鼓励患者合理利用医疗资源。同时，不同医院可能还有不同的起付线、封顶线等规定。提醒：如果发现报销比例差异较大，或遇到报销受阻的情况，可能表明问题比较严重，应及时咨询当地新农合管理部门或寻求专业法律人士的帮助。
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具体操作：1.查询政策文件：登录当地卫健委或新农合官方网站，查询最新的报销政策文件，了解不同级别医院的报销比例、起付线、封顶线等规定。2.咨询管理部门：携带个人身份证、新农合卡及相关医疗费用票据，前往当地新农合管理部门咨询窗口，获取具体的报销标准和流程。3.申请行政复议：若认为报销决定违法或不当，可向作出该决定的上一级新农合管理部门提出行政复议申请，附上相关证据材料。4.提起行政诉讼：若行政复议结果不满意，可向人民法院提起行政诉讼，通过法律途径维护自身合法权益。在此过程中，需准备充分的证据材料，并遵循法院的诉讼程序。请注意，以上操作需根据具体情况灵活调整，并建议在专业法律人士的指导下进行。
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处理方式：从法律角度看，处理新农合报销问题的方式主要有：查询政策文件、咨询当地新农合管理部门、申请行政复议或提起行政诉讼。选择方式时，建议先查询相关政策文件，了解报销标准和规定；若仍有疑问，可咨询当地新农合管理部门获取具体解答；若认为权益受到侵害，可考虑申请行政复议或提起行政诉讼来维护自身权益。